Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAMP3O14828 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP3O14828 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms