Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AGRPO00253 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRPO00253 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGRPO00253 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRPO00253 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRPO00253 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGRPO00253 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms