Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA1C9JL84 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA1C9JL84 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms