Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 RAB30-201ENST00000260056 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 RNA5SP358-201ENST00000362973 117 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 CDY6P-201ENST00000413320 1266 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TRAV33-201ENST00000557514 338 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ATRXP46100 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PPP1R32-202ENST00000366212 488 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRXP46100 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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