Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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