RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.74■■■□□ 2.67
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.15■■■□□ 2.1
CCDC42-201ENST00000293845 ABCC9O60706 1549 aa27.1■■□□□ 1.93
CCDC42-201ENST00000293845 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CCDC42-201ENST00000293845 NACADO15069 1562 aa26.35■■□□□ 1.81
CCDC42-201ENST00000293845 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC42-201ENST00000293845 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC42-201ENST00000293845 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.28■■□□□ 1.8
CCDC42-201ENST00000293845 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.21■■□□□ 1.79
CCDC42-201ENST00000293845 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.76■■□□□ 1.71
CCDC42-201ENST00000293845 SCRIBQ14160 1630 aa25.62■■□□□ 1.69
CCDC42-201ENST00000293845 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC42-201ENST00000293845 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
CCDC42-201ENST00000293845 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.29■■□□□ 1.64
CCDC42-201ENST00000293845 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CCDC42-201ENST00000293845 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.66■■□□□ 1.54
CCDC42-201ENST00000293845 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CCDC42-201ENST00000293845 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.59■■□□□ 1.53
CCDC42-201ENST00000293845 SMARCA4P51532 1647 aa24.58■■□□□ 1.52
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.55■■□□□ 1.52
CCDC42-201ENST00000293845 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.45■■□□□ 1.5
CCDC42-201ENST00000293845 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC42-201ENST00000293845 SMARCA2P51531 1590 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC42-201ENST00000293845 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC42-201ENST00000293845 NCAPD3P42695 1498 aa24.28■■□□□ 1.48
CCDC42-201ENST00000293845 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CCDC42-201ENST00000293845 HMGXB3Q12766 1538 aa24.23■■□□□ 1.47
CCDC42-201ENST00000293845 WIZO95785 1651 aa24.22■■□□□ 1.47
CCDC42-201ENST00000293845 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CCDC42-201ENST00000293845 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CCDC42-201ENST00000293845 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.67■■□□□ 1.38
CCDC42-201ENST00000293845 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.62■■□□□ 1.37
CCDC42-201ENST00000293845 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC42-201ENST00000293845 NESP48681 1621 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC42-201ENST00000293845 CFTRP13569 1480 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC42-201ENST00000293845 PRDM2Q13029 1718 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC42-201ENST00000293845 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC42-201ENST00000293845 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC42-201ENST00000293845 ERCC6Q03468 1493 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC42-201ENST00000293845 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.29■■□□□ 1.32
CCDC42-201ENST00000293845 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.24■■□□□ 1.31
CCDC42-201ENST00000293845 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CCDC42-201ENST00000293845 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.15■■□□□ 1.3
CCDC42-201ENST00000293845 WDR62O43379 1518 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC42-201ENST00000293845 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCDC42-201ENST00000293845 CUX2O14529 1486 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC42-201ENST00000293845 ABCC8Q09428 1581 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC42-201ENST00000293845 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23■■□□□ 1.27
CCDC42-201ENST00000293845 TOPBP1Q92547 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC42-201ENST00000293845 CUX1P39880 1505 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-201ENST00000293845 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
CCDC42-201ENST00000293845 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC42-201ENST00000293845 TOP2BQ02880 1626 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC42-201ENST00000293845 SYNJ1O43426 1573 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC42-201ENST00000293845 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCDC42-201ENST00000293845 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC42-201ENST00000293845 IFT140Q96RY7 1462 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC42-201ENST00000293845 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCDC42-201ENST00000293845 SOGA1O94964 1423 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC42-201ENST00000293845 WDR97A6NE52 1622 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC42-201ENST00000293845 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC42-201ENST00000293845 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.61■■□□□ 1.21
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCDC42-201ENST00000293845 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCDC42-201ENST00000293845 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.52■■□□□ 1.2
CCDC42-201ENST00000293845 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM41Q8WV44 630 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC42-201ENST00000293845 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCDC42-201ENST00000293845 PBRM1Q86U86 1689 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC42-201ENST00000293845 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC42-201ENST00000293845 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC42-201ENST00000293845 GRIN2BQ13224 1484 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC42-201ENST00000293845 KIF27Q86VH2 1401 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC42-201ENST00000293845 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC42-201ENST00000293845 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCDC42-201ENST00000293845 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC42-201ENST00000293845 ADAMTS12P58397 1594 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC42-201ENST00000293845 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC42-201ENST00000293845 CHD1O14646 1710 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC42-201ENST00000293845 SYNJ2O15056 1496 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC42-201ENST00000293845 IGF1RP08069 1367 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC42-201ENST00000293845 CUL7Q14999 1698 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC42-201ENST00000293845 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC42-201ENST00000293845 EEA1Q15075 1411 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC42-201ENST00000293845 GRIN2AQ12879 1464 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-201ENST00000293845 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-201ENST00000293845 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-201ENST00000293845 FBLN2P98095 1184 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-201ENST00000293845 OSCARQ8IYS5 282 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC42-201ENST00000293845 PRXQ9BXM0 1461 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC42-201ENST00000293845 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC42-201ENST00000293845 NUP160Q12769 1436 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC42-201ENST00000293845 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC42-201ENST00000293845 CEP170Q5SW79 1584 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC42-201ENST00000293845 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC42-201ENST00000293845 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCDC42-201ENST00000293845 KIF21BO75037 1637 aa21.96■■□□□ 1.11
CCDC42-201ENST00000293845 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.88■■□□□ 1.09
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