Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGS1P23219 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGS1P23219 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms