Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL606970.1-201ENST00000445442 2559 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 VIPAS39-211ENST00000557658 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM7-202ENST00000449207 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM1-204ENST00000369256 3203 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP12-203ENST00000391772 3205 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PLXDC1-206ENST00000444911 2082 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDE6B-201ENST00000255622 3280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 UGT1A9-201ENST00000354728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK1G-202ENST00000361322 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CLP1-205ENST00000533682 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM47B-201ENST00000329357 2120 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL606534.6-201ENST00000611420 1838 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TFIP11-202ENST00000407148 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LRTOMT-222ENST00000615940 1895 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV2-201ENST00000338560 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC012313.5-201ENST00000594816 2517 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms