Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTMAP06454 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTMAP06454 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms