Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP10-201ENST00000328600 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM106B-202ENST00000396668 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM1A-201ENST00000424240 2129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC055813.1-201ENST00000587110 2123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL591742.2-201ENST00000632517 2119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP25-202ENST00000409202 2945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CALCOCO1-202ENST00000430117 2706 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KLK2-201ENST00000325321 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CNBD2-201ENST00000349339 1927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLA-203ENST00000427060 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP69-213ENST00000497910 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ASIC1-208ENST00000552438 3327 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BEND3P1-202ENST00000449695 2762 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF6-201ENST00000370040 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF4-202ENST00000613157 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC055717.1-201ENST00000502221 1986 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-F-AS1-209ENST00000458236 2835 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms