Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms