Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YBX2Q9Y2T7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms