Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms