Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERG28Q9UKR5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms