Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS51Q9UID3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS51Q9UID3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS51Q9UID3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS51Q9UID3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS51Q9UID3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS51Q9UID3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS51Q9UID3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS51Q9UID3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms