Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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COPS7AQ9UBW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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