Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L1Q9P0L9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms