Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 21.88□□□□□ -2.119e-20■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 25.47□□□□□ -1.532e-19■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.292e-19■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.392e-6■■■□□ 17.7
AATFQ9NY61 NCOA1-207ENST00000469850 537 ntTSL 520.44■□□□□ 0.862e-6■■■□□ 17.6
AATFQ9NY61 NCOA1-211ENST00000496333 501 ntTSL 320.3■□□□□ 0.842e-6■■■□□ 17.6
AATFQ9NY61 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 17.6
AATFQ9NY61 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■■□□ 17.6
AATFQ9NY61 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.355e-17■■■□□ 17.5
AATFQ9NY61 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.435e-17■■■□□ 17.5
AATFQ9NY61 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-17■■■□□ 17.5
AATFQ9NY61 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■□□ 17.5
AATFQ9NY61 FAM182B-205ENST00000478164 992 ntTSL 519.29■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 17.5
AATFQ9NY61 FAM182B-207ENST00000582267 832 ntTSL 517.35■□□□□ 0.373e-7■■■□□ 17.5
AATFQ9NY61 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.981e-7■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-7■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 521.95■■□□□ 1.16e-13■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.726e-13■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.726e-13■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1□□□□□ -2.253e-51■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.992e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.942e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-205ENST00000558339 582 ntTSL 427.1■■□□□ 1.932e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.712e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 DPH7-210ENST00000479650 1797 ntTSL 522.12■■□□□ 1.132e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 DPH7-207ENST00000475100 919 ntTSL 320.29■□□□□ 0.842e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-211ENST00000560564 607 ntTSL 419.81■□□□□ 0.762e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 DPH7-206ENST00000472113 1414 ntTSL 518.74■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 DPH7-212ENST00000485189 797 ntTSL 318.54■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-204ENST00000557795 747 ntTSL 518.25■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 517.83■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 MTA1-205ENST00000426567 568 ntTSL 317.54■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-206ENST00000558415 562 ntTSL 317.52■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 417.51■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 DPH7-209ENST00000477690 1220 ntTSL 317.38■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 DPH7-204ENST00000467768 750 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-214ENST00000561088 560 ntTSL 414.97□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-210ENST00000559677 553 ntTSL 311.14□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SPG21-207ENST00000558765 624 ntTSL 310.98□□□□□ -0.652e-6■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-323■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC12.75□□□□□ -0.371e-323■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 54.81□□□□□ -1.641e-323■■■□□ 17.4
AATFQ9NY61 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 322.21■■□□□ 1.153e-18■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 37.68□□□□□ -1.182e-38■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 GYPC-205ENST00000464053 1805 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 GYPC-204ENST00000459787 758 ntTSL 317.44■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 223.48■■□□□ 1.352e-14■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.312e-14■■■□□ 17.3
AATFQ9NY61 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 37.62□□□□□ -1.191e-9■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.78■■□□□ 1.245e-43■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.99■□□□□ 0.955e-43■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 217.43■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 215.43■□□□□ 0.064e-6■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 334.09■■■■□ 3.055e-6■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.445e-6■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.95e-6■■■□□ 17.2
AATFQ9NY61 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-7■■■□□ 17.1
AATFQ9NY61 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.812e-6■■■□□ 17.1
AATFQ9NY61 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.712e-6■■■□□ 17.1
AATFQ9NY61 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.612e-10■■■□□ 17.1
AATFQ9NY61 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.432e-10■■■□□ 17.1
AATFQ9NY61 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 416.57■□□□□ 0.242e-10■■■□□ 17.1
AATFQ9NY61 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)10.2□□□□□ -0.782e-10■■■□□ 17.1
AATFQ9NY61 ANXA11-208ENST00000463657 780 ntTSL 522.42■■□□□ 1.181e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.388e-19■■■□□ 17
AATFQ9NY61 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.071e-323■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 426.58■■□□□ 1.855e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 225.83■■□□□ 1.735e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 424.09■■□□□ 1.455e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.125e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.925e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 320.18■□□□□ 0.825e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 420.01■□□□□ 0.795e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 319.37■□□□□ 0.695e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 317.24■□□□□ 0.355e-6■■■□□ 17
AATFQ9NY61 SEPT5-212ENST00000470814 2353 ntTSL 523.35■■□□□ 1.333e-8■■■□□ 17
AATFQ9NY61 SEPT5-211ENST00000455843 4113 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.273e-8■■■□□ 17
AATFQ9NY61 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.663e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 ZDHHC8-204ENST00000436518 557 ntTSL 419.13■□□□□ 0.653e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 317.48■□□□□ 0.393e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.313e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.33e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.143e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-9■■■□□ 16.9
AATFQ9NY61 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.111e-323■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 328.14■■■□□ 2.11e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 224.01■■□□□ 1.431e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 520.88■□□□□ 0.931e-22■■■□□ 16.8
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