Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MED29Q9NX70 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms