Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf109Q9NX04 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms