Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN3Q9NQS3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN3Q9NQS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms