Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOJQ9H4E5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms