Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BHLHE41Q9C0J9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE41Q9C0J9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms