Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RAB11FIP5Q9BXF6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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