Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTA3Q9BTC8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTA3Q9BTC8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTA3Q9BTC8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms