Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms