Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZSWIM1Q9BR11 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZSWIM1Q9BR11 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms