Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA3Q96EY1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA3Q96EY1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms