Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PPM1KQ8N3J5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1KQ8N3J5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms