Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00269Q8N2A0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms