Protein–RNA interactions for Protein: Q86U90

YRDC, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YRDCQ86U90 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
YRDCQ86U90 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YRDCQ86U90 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms