Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRFIP1Q32MZ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRFIP1Q32MZ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms