Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.47e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 G3BP2-206ENST00000503660 1071 ntTSL 512.3□□□□□ -0.447e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 512.14□□□□□ -0.477e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.487e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.537e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 G3BP2-205ENST00000502654 546 ntTSL 411.3□□□□□ -0.67e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.617e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.647e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.647e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.697e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 TMEM165-206ENST00000508561 756 ntTSL 510.46□□□□□ -0.737e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 510.29□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.787e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.817e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 MPP1-209ENST00000453245 729 ntTSL 510□□□□□ -0.812e-6■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.917e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.997e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 TMEM165-210ENST00000514904 1522 ntTSL 28.37□□□□□ -1.077e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 TMEM165-212ENST00000608091 1567 ntTSL 38.33□□□□□ -1.087e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.137e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.157e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.217e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 G3BP2-211ENST00000507947 665 ntTSL 26.96□□□□□ -1.37e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.347e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.467e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 TMEM165-208ENST00000511710 731 ntTSL 35.89□□□□□ -1.477e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-213ENST00000636666 3642 ntTSL 55.54□□□□□ -1.527e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 G3BP2-215ENST00000510902 338 ntTSL 33.65□□□□□ -1.837e-7■■□□□ 12.6
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SRSF7Q16629 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.512e-12■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.522e-12■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-7■■□□□ 12.5
SRSF7Q16629 RBM33-209ENST00000440108 1027 ntTSL 513.9□□□□□ -0.183e-7■■□□□ 12.5
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SRSF7Q16629 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 28.76□□□□□ -1.013e-7■■□□□ 12.5
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SRSF7Q16629 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 12.5
SRSF7Q16629 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 12.5
SRSF7Q16629 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.41e-9■■□□□ 12.5
SRSF7Q16629 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.491e-9■■□□□ 12.5
SRSF7Q16629 ARGLU1-204ENST00000472226 1336 ntTSL 25.72□□□□□ -1.495e-10■■□□□ 12.5
SRSF7Q16629 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.241e-16■■□□□ 12.5
SRSF7Q16629 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.885e-6■■□□□ 12.4
SRSF7Q16629 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.25e-6■■□□□ 12.4
SRSF7Q16629 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.35e-6■■□□□ 12.4
SRSF7Q16629 SNX5-204ENST00000431277 840 ntTSL 512.53□□□□□ -0.45e-6■■□□□ 12.4
SRSF7Q16629 SNX5-203ENST00000419004 778 ntTSL 511.73□□□□□ -0.535e-6■■□□□ 12.4
SRSF7Q16629 SNX5-211ENST00000483485 3087 ntTSL 26.36□□□□□ -1.395e-6■■□□□ 12.4
SRSF7Q16629 SNX5-205ENST00000463050 845 ntTSL 25.77□□□□□ -1.495e-6■■□□□ 12.4
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SRSF7Q16629 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.144e-8■■□□□ 12.4
SRSF7Q16629 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.457e-15■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.525e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 RAB11FIP3-208ENST00000464263 329 ntTSL 312.36□□□□□ -0.435e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 WDR6-219ENST00000498023 626 ntTSL 211.31□□□□□ -0.65e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 RAB11FIP3-207ENST00000461009 514 ntTSL 210.64□□□□□ -0.715e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.725e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 310.28□□□□□ -0.765e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.1□□□□□ -0.795e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.835e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 38.63□□□□□ -1.035e-8■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.271e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 512□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-223ENST00000476187 593 ntTSL 410.2□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.831e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SLC20A1-204ENST00000433924 638 ntTSL 49.68□□□□□ -0.861e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 49.25□□□□□ -0.931e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 28.92□□□□□ -0.981e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SLC20A1-209ENST00000498224 692 ntTSL 28.91□□□□□ -0.981e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SLC20A1-206ENST00000480984 738 ntTSL 55.55□□□□□ -1.521e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 STARD7-204ENST00000479456 2949 ntTSL 25.32□□□□□ -1.561e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SLC20A1-205ENST00000456264 574 ntTSL 45.25□□□□□ -1.571e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SLC20A1-207ENST00000490674 3202 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.651e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 SLC20A1-202ENST00000413135 584 ntTSL 54.43□□□□□ -1.71e-6■■□□□ 12.3
SRSF7Q16629 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.321e-9■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-9■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.365e-9■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-9■■□□□ 12.2
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