Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEUROD1Q13562 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEUROD1Q13562 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
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