Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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