Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ATP6V1B2-204ENST00000521442 738 ntTSL 38.21□□□□□ -1.16e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 25.83□□□□□ -1.486e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 HERC1-207ENST00000560316 577 ntTSL 417.42■□□□□ 0.385e-8■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 HERC1-205ENST00000559886 2462 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.585e-8■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 HERC1-208ENST00000560462 647 ntTSL 27.24□□□□□ -1.255e-8■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 HERC1-203ENST00000558532 581 ntTSL 33.68□□□□□ -1.825e-8■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 SMAD3-213ENST00000560175 542 ntTSL 413.14□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 30.1
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TARDBPQ13148 RABGAP1L-219ENST00000526253 439 ntTSL 58.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ITGA5-213ENST00000553071 1013 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.242e-17■■■■■ 30
TARDBPQ13148 ITGA5-202ENST00000435631 1240 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-17■■■■■ 30
TARDBPQ13148 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-17■■■■■ 30
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TARDBPQ13148 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 30
TARDBPQ13148 SUN1-234ENST00000493681 526 ntTSL 312.27□□□□□ -0.453e-13■■■■■ 30
TARDBPQ13148 SUN1-228ENST00000471349 569 ntTSL 44.35□□□□□ -1.713e-13■■■■■ 30
TARDBPQ13148 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)22.29■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 30
TARDBPQ13148 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 30
TARDBPQ13148 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 30
TARDBPQ13148 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.996e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.036e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 NRDC-211ENST00000491410 1020 ntTSL 219.77■□□□□ 0.763e-12■■■■■ 30
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TARDBPQ13148 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-12■■■■■ 30
TARDBPQ13148 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-12■■■■■ 30
TARDBPQ13148 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.483e-12■■■■■ 30
TARDBPQ13148 UBE3A-221ENST00000630607 1873 ntTSL 38.64□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 30
TARDBPQ13148 UBE3A-217ENST00000628890 424 ntTSL 34.62□□□□□ -1.675e-7■■■■■ 30
TARDBPQ13148 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 30
TARDBPQ13148 MEIS2-227ENST00000607277 705 ntTSL 38.77□□□□□ -1.018e-7■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-221ENST00000514588 490 ntTSL 424.6■■□□□ 1.538e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.438e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.268e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.098e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-219ENST00000513956 562 ntTSL 218.43■□□□□ 0.548e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-211ENST00000508143 574 ntTSL 418.43■□□□□ 0.548e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-214ENST00000511161 579 ntTSL 418.43■□□□□ 0.548e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-209ENST00000505884 592 ntTSL 418.43■□□□□ 0.548e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-208ENST00000505672 932 ntTSL 218.37■□□□□ 0.538e-9■■■■■ 30
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TARDBPQ13148 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.268e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-206ENST00000502771 544 ntTSL 415.42■□□□□ 0.068e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-216ENST00000511686 576 ntTSL 315.19■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-220ENST00000514382 476 ntTSL 413.9□□□□□ -0.188e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-9■■■■■ 30
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TARDBPQ13148 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.58e-9■■■■■ 30
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TARDBPQ13148 SMG6-218ENST00000575454 652 ntTSL 39.41□□□□□ -0.98e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.968e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.048e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 SMG6-208ENST00000570874 533 ntTSL 43.36□□□□□ -1.878e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 SLC6A6-211ENST00000622810 565 ntTSL 416.95■□□□□ 0.36e-12■■■■■ 30
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TARDBPQ13148 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 LINC00963-206ENST00000453213 469 ntTSL 39.13□□□□□ -0.951e-9■■■■■ 30
TARDBPQ13148 LINC00963-209ENST00000607931 473 ntTSL 58.69□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 30
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TARDBPQ13148 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)19.98■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-24■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-24■■■■■ 29.9
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TARDBPQ13148 WSCD2-210ENST00000551106 552 ntTSL 415.75■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 WSCD2-202ENST00000546401 535 ntTSL 311.1□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 WSCD2-209ENST00000551057 565 ntTSL 310.95□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 C4orf33-205ENST00000508622 465 ntTSL 56.82□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 WSCD2-212ENST00000551734 543 ntTSL 46.56□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 C4orf33-206ENST00000508673 396 ntTSL 56.36□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.711e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 29.9
TARDBPQ13148 BTBD1-204ENST00000559652 797 ntTSL 36.94□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 29.9
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