Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms