Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms