Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTG1P63261 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTG1P63261 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms