Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 215.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 FAM182B-203ENST00000424021 605 ntTSL 515.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 315.21■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 515.11■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 215.11■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-208ENST00000505550 534 ntTSL 215□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-210ENST00000552886 330 ntTSL 315□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.015e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 AKT1-210ENST00000554826 572 ntTSL 314.77□□□□□ -0.055e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 PLEKHG2-201ENST00000205135 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.42□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-211ENST00000514833 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.09□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 413.7□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 413.67□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CUTC-203ENST00000471520 831 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-238ENST00000622457 547 ntTSL 212.8□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-207ENST00000418951 5062 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 UBE2O-204ENST00000587127 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 212.1□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-215ENST00000611738 4817 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-213ENST00000538149 4797 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-205ENST00000399781 999 ntTSL 311.97□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 511.63□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 211.62□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-216ENST00000616863 4761 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-211ENST00000493680 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-212ENST00000498133 2662 ntTSL 210.88□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.33□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 49.52□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-206ENST00000510667 534 ntTSL 37.47□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 57.36□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 EIF5A-203ENST00000355068 923 ntTSL 27.31□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 26.77□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-209ENST00000512130 525 ntTSL 36.5□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RBBP6-205ENST00000562430 6482 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.555e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SPART-208ENST00000491805 668 ntTSL 25.16□□□□□ -1.585e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.655e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-211ENST00000515597 664 ntTSL 1 (best)4.09□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-210ENST00000513153 695 ntTSL 33.8□□□□□ -1.85e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LINC01088-204ENST00000507761 842 ntTSL 23.57□□□□□ -1.845e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 34.6
AARSP49588 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 34.6
AARSP49588 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -04e-6■■■■■ 34.6
AARSP49588 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 34.6
AARSP49588 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 34.6
AARSP49588 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.675e-6■■■■■ 34.4
AARSP49588 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.65e-6■■■■■ 34.4
AARSP49588 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 323.09■■□□□ 1.295e-6■■■■■ 34.4
AARSP49588 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 322.82■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 34.4
AARSP49588 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 34.4
AARSP49588 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 34.4
AARSP49588 CAMTA1-213ENST00000490738 538 ntTSL 229.42■■■□□ 2.37e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 GALNT2-203ENST00000488903 593 ntTSL 228.01■■■□□ 2.077e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 NPLOC4-217ENST00000574897 2365 ntTSL 225.49■■□□□ 1.677e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.447e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.23e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.197e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 CAMTA1-209ENST00000476163 863 ntTSL 220.96■□□□□ 0.957e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-206ENST00000432089 599 ntTSL 320.94■□□□□ 0.943e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-210ENST00000467451 743 ntTSL 220.09■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.787e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-207ENST00000460996 908 ntTSL 219.39■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-209ENST00000466877 1080 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-202ENST00000370011 538 ntTSL 516.59■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 NAA10-215ENST00000484950 873 ntTSL 216.24■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 34.3
AARSP49588 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.147e-9■■■■■ 34.3
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