Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC11A1P49279 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms