Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA3P32297 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms