Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX1P22670 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX1P22670 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX1P22670 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX1P22670 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX1P22670 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX1P22670 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX1P22670 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX1P22670 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX1P22670 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX1P22670 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX1P22670 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX1P22670 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX1P22670 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms