Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTF3P20783 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTF3P20783 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTF3P20783 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NTF3P20783 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTF3P20783 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTF3P20783 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTF3P20783 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTF3P20783 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTF3P20783 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTF3P20783 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms