Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNNI3P19429 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms