Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP9O43818 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP9O43818 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP9O43818 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP9O43818 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RRP9O43818 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP9O43818 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP9O43818 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP9O43818 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP9O43818 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP9O43818 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP9O43818 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP9O43818 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP9O43818 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP9O43818 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP9O43818 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP9O43818 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP9O43818 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP9O43818 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP9O43818 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP9O43818 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP9O43818 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP9O43818 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP9O43818 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP9O43818 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP9O43818 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP9O43818 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP9O43818 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP9O43818 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP9O43818 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP9O43818 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP9O43818 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP9O43818 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP9O43818 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP9O43818 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP9O43818 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP9O43818 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP9O43818 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP9O43818 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP9O43818 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP9O43818 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP9O43818 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRP9O43818 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRP9O43818 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms