Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 VGLL4-218ENST00000623028 728 ntTSL 517.8■□□□□ 0.445e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 417.26■□□□□ 0.355e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 MEMO1-205ENST00000413686 769 ntTSL 315.13■□□□□ 0.015e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 314.63□□□□□ -0.075e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.15e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 314.21□□□□□ -0.135e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.155e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 MIIP-206ENST00000492256 806 ntTSL 213.58□□□□□ -0.245e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 313.28□□□□□ -0.285e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 KAT5-206ENST00000527544 745 ntTSL 212.94□□□□□ -0.345e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 KAT5-215ENST00000534293 559 ntTSL 311.33□□□□□ -0.65e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.635e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 KAT5-209ENST00000530605 499 ntTSL 310.05□□□□□ -0.85e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 OCRL-204ENST00000486673 942 ntTSL 510.04□□□□□ -0.85e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 VGLL4-217ENST00000480288 586 ntTSL 48.84□□□□□ -0.995e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 AL360181.1-201ENST00000452591 184 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -15e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 KDM3A-215ENST00000498528 352 ntTSL 35.7□□□□□ -1.55e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 314.87□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 413.5□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.458e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.298e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.298e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 513.73□□□□□ -0.214e-10■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 TNS1-214ENST00000479185 2513 ntTSL 512.96□□□□□ -0.334e-10■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.027e-9■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.987e-9■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.585e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.046e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 MRPS2-203ENST00000453385 810 ntTSL 218.75■□□□□ 0.596e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.566e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 MRPS2-207ENST00000485333 881 ntTSL 218.55■□□□□ 0.566e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 MRPS2-205ENST00000472852 854 ntTSL 317.05■□□□□ 0.326e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 MRPS2-204ENST00000462948 551 ntTSL 217.05■□□□□ 0.326e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 MRPS2-208ENST00000488610 928 ntTSL 316.62■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.733e-8■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.463e-8■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 NEURL4-206ENST00000571887 4291 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.96□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 ABCA2-211ENST00000464520 886 ntTSL 223.48■■□□□ 1.355e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 ABCA2-220ENST00000490486 666 ntTSL 214.86□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.693e-10■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 413.89□□□□□ -0.193e-10■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.456e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 TMEM184A-209ENST00000449955 2224 ntTSL 219.98■□□□□ 0.797e-9■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 TMEM184A-206ENST00000421996 409 ntTSL 317.42■□□□□ 0.387e-9■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PHF23-207ENST00000573826 685 ntTSL 318.67■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PHF23-211ENST00000574899 370 ntTSL 322.03■■□□□ 1.126e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PHF23-208ENST00000574236 583 ntTSL 322.03■■□□□ 1.126e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 PHF23-206ENST00000572789 1006 ntTSL 217.26■□□□□ 0.356e-7■■■■□ 25.2
PRPF4O43172 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 29.19□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 CDK5RAP2-218ENST00000491334 546 ntTSL 218.3■□□□□ 0.522e-16■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.313e-14■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 PPP1R3E-205ENST00000560073 444 ntTSL 54.18□□□□□ -1.741e-11■■■■□ 25.1
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PRPF4O43172 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 312.44□□□□□ -0.428e-7■■■■□ 25.1
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PRPF4O43172 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-7■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-7■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.28e-7■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.033e-7■■■■□ 25.1
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PRPF4O43172 TOLLIP-205ENST00000527638 561 ntTSL 419.19■□□□□ 0.663e-7■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 TOLLIP-211ENST00000530541 684 ntTSL 215.67■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.311e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.311e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 25.1
PRPF4O43172 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.591e-7■■■■□ 25
PRPF4O43172 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 25
PRPF4O43172 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 219.33■□□□□ 0.682e-7■■■■□ 25
PRPF4O43172 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 25
PRPF4O43172 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 211.76□□□□□ -0.537e-7■■■■□ 25
PRPF4O43172 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 210.85□□□□□ -0.677e-7■■■■□ 25
PRPF4O43172 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.438e-10■■■■□ 25
PRPF4O43172 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.677e-10■■■■□ 25
PRPF4O43172 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 416.05■□□□□ 0.167e-10■■■■□ 25
PRPF4O43172 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-10■■■■□ 25
PRPF4O43172 IQSEC1-203ENST00000474467 436 ntTSL 37.78□□□□□ -1.167e-10■■■■□ 25
PRPF4O43172 AC135048.1-202ENST00000562642 626 ntTSL 37.41□□□□□ -1.222e-12■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-217ENST00000530650 2094 ntTSL 1 (best)22.61■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-215ENST00000529414 749 ntTSL 320.41■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-216ENST00000529601 1671 ntTSL 220.32■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-224ENST00000533766 1547 ntTSL 519.91■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-221ENST00000531321 945 ntTSL 318.84■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-214ENST00000529292 1305 ntTSL 518.8■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-218ENST00000530750 365 ntTSL 518.78■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 25
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