RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530650.5

TM7SF2-217, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TM7SF2, Length 2,094 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-217ENST00000530650 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.77■■■■■ 5.56
TM7SF2-217ENST00000530650 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.34■■■■■ 4.53
TM7SF2-217ENST00000530650 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
TM7SF2-217ENST00000530650 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.4■■■■■ 4.22
TM7SF2-217ENST00000530650 ABCC9O60706 1549 aa41.37■■■■■ 4.21
TM7SF2-217ENST00000530650 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41■■■■■ 4.15
TM7SF2-217ENST00000530650 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.79■■■■■ 4.12
TM7SF2-217ENST00000530650 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.51■■■■■ 4.08
TM7SF2-217ENST00000530650 NACADO15069 1562 aa40.42■■■■■ 4.06
TM7SF2-217ENST00000530650 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.14■■■■■ 4.02
TM7SF2-217ENST00000530650 SCRIBQ14160 1630 aa40.07■■■■■ 4.01
TM7SF2-217ENST00000530650 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.47■■■■□ 3.91
TM7SF2-217ENST00000530650 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
TM7SF2-217ENST00000530650 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.07■■■■□ 3.84
TM7SF2-217ENST00000530650 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.04■■■■□ 3.84
TM7SF2-217ENST00000530650 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.83■■■■□ 3.81
TM7SF2-217ENST00000530650 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
TM7SF2-217ENST00000530650 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.54■■■■□ 3.76
TM7SF2-217ENST00000530650 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
TM7SF2-217ENST00000530650 SMARCA4P51532 1647 aa38.3■■■■□ 3.72
TM7SF2-217ENST00000530650 WIZO95785 1651 aa38.25■■■■□ 3.71
TM7SF2-217ENST00000530650 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
TM7SF2-217ENST00000530650 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.73■■■■□ 3.63
TM7SF2-217ENST00000530650 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
TM7SF2-217ENST00000530650 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.71■■■■□ 3.63
TM7SF2-217ENST00000530650 SMARCA2P51531 1590 aa37.59■■■■□ 3.61
TM7SF2-217ENST00000530650 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
TM7SF2-217ENST00000530650 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.41■■■■□ 3.58
TM7SF2-217ENST00000530650 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.36■■■■□ 3.57
TM7SF2-217ENST00000530650 NCAPD3P42695 1498 aa37.33■■■■□ 3.57
TM7SF2-217ENST00000530650 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.31■■■■□ 3.56
TM7SF2-217ENST00000530650 HMGXB3Q12766 1538 aa37.24■■■■□ 3.55
TM7SF2-217ENST00000530650 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.7■■■■□ 3.47
TM7SF2-217ENST00000530650 TRIM41Q8WV44 630 aa36.69■■■■□ 3.46
TM7SF2-217ENST00000530650 ABCC8Q09428 1581 aa36.67■■■■□ 3.46
TM7SF2-217ENST00000530650 CFTRP13569 1480 aa36.51■■■■□ 3.43
TM7SF2-217ENST00000530650 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.42■■■■□ 3.42
TM7SF2-217ENST00000530650 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.32■■■■□ 3.415e-6■■■■■ 29.2
TM7SF2-217ENST00000530650 NESP48681 1621 aa36.31■■■■□ 3.4
TM7SF2-217ENST00000530650 PRDM2Q13029 1718 aa36.27■■■■□ 3.4
TM7SF2-217ENST00000530650 SYNJ1O43426 1573 aa36.25■■■■□ 3.39
TM7SF2-217ENST00000530650 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
TM7SF2-217ENST00000530650 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.07■■■■□ 3.37
TM7SF2-217ENST00000530650 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.05■■■■□ 3.36
TM7SF2-217ENST00000530650 CUX1P39880 1505 aa36.03■■■■□ 3.36
TM7SF2-217ENST00000530650 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.02■■■■□ 3.36
TM7SF2-217ENST00000530650 TOP2BQ02880 1626 aa36.01■■■■□ 3.35
TM7SF2-217ENST00000530650 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.97■■■■□ 3.35
TM7SF2-217ENST00000530650 SOGA1O94964 1423 aa35.94■■■■□ 3.34
TM7SF2-217ENST00000530650 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.87■■■■□ 3.33
TM7SF2-217ENST00000530650 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.82■■■■□ 3.33
TM7SF2-217ENST00000530650 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.81■■■■□ 3.32
TM7SF2-217ENST00000530650 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.8■■■■□ 3.32
TM7SF2-217ENST00000530650 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.8■■■■□ 3.32
TM7SF2-217ENST00000530650 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.65■■■■□ 3.3
TM7SF2-217ENST00000530650 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
TM7SF2-217ENST00000530650 TOPBP1Q92547 1522 aa35.65■■■■□ 3.3
TM7SF2-217ENST00000530650 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.64■■■■□ 3.3
TM7SF2-217ENST00000530650 EEA1Q15075 1411 aa35.59■■■■□ 3.29
TM7SF2-217ENST00000530650 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.58■■■■□ 3.29
TM7SF2-217ENST00000530650 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
TM7SF2-217ENST00000530650 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.45■■■■□ 3.27
TM7SF2-217ENST00000530650 CUX2O14529 1486 aa35.4■■■■□ 3.26
TM7SF2-217ENST00000530650 ERCC6Q03468 1493 aa35.4■■■■□ 3.26
TM7SF2-217ENST00000530650 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.4■■■■□ 3.26
TM7SF2-217ENST00000530650 KIF27Q86VH2 1401 aa35.37■■■■□ 3.25
TM7SF2-217ENST00000530650 HRCP23327 699 aa35.34■■■■□ 3.25
TM7SF2-217ENST00000530650 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.24■■■■□ 3.23
TM7SF2-217ENST00000530650 KIF21BO75037 1637 aa35.22■■■■□ 3.23
TM7SF2-217ENST00000530650 GOLGA3Q08378 1498 aa35.21■■■■□ 3.23
TM7SF2-217ENST00000530650 WDR62O43379 1518 aa35.21■■■■□ 3.23
TM7SF2-217ENST00000530650 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.18■■■■□ 3.22
TM7SF2-217ENST00000530650 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
TM7SF2-217ENST00000530650 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
TM7SF2-217ENST00000530650 WDR97A6NE52 1622 aa35.17■■■■□ 3.22
TM7SF2-217ENST00000530650 IGF1RP08069 1367 aa35.14■■■■□ 3.22
TM7SF2-217ENST00000530650 PRXQ9BXM0 1461 aa35.12■■■■□ 3.21
TM7SF2-217ENST00000530650 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
TM7SF2-217ENST00000530650 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
TM7SF2-217ENST00000530650 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.07■■■■□ 3.2
TM7SF2-217ENST00000530650 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.99■■■■□ 3.19
TM7SF2-217ENST00000530650 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.97■■■■□ 3.19
TM7SF2-217ENST00000530650 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.96■■■■□ 3.19
TM7SF2-217ENST00000530650 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.95■■■■□ 3.19
TM7SF2-217ENST00000530650 CEP162Q5TB80 1403 aa34.94■■■■□ 3.18
TM7SF2-217ENST00000530650 IFT140Q96RY7 1462 aa34.92■■■■□ 3.18
TM7SF2-217ENST00000530650 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.91■■■■□ 3.188e-6■■■■□ 23.2
TM7SF2-217ENST00000530650 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
TM7SF2-217ENST00000530650 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.87■■■■□ 3.17
TM7SF2-217ENST00000530650 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
TM7SF2-217ENST00000530650 CUL7Q14999 1698 aa34.78■■■■□ 3.16
TM7SF2-217ENST00000530650 PBRM1Q86U86 1689 aa34.78■■■■□ 3.16
TM7SF2-217ENST00000530650 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
TM7SF2-217ENST00000530650 CLIP1P30622 1438 aa34.69■■■■□ 3.14
TM7SF2-217ENST00000530650 GRIN2BQ13224 1484 aa34.66■■■■□ 3.14
TM7SF2-217ENST00000530650 ADAMTS12P58397 1594 aa34.56■■■■□ 3.12
TM7SF2-217ENST00000530650 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.53■■■■□ 3.12
TM7SF2-217ENST00000530650 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.53■■■■□ 3.12
TM7SF2-217ENST00000530650 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.1
TM7SF2-217ENST00000530650 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.44■■■■□ 3.1
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