Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms