Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDR42E2A6NKP2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDR42E2A6NKP2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms